棉花是世界最大的纖維作物和紡織工業(yè)原料。棉紡織品具有優(yōu)越的透氣性、舒適性、保暖性，深受人們的喜愛。目前被人類馴化的四倍體棉花有陸地棉和海島棉。陸地棉產(chǎn)量高，纖維好，適應(yīng)性廣，產(chǎn)量占世界棉花總產(chǎn)的90%以上。長、強、細，光滑有色澤的海島棉又稱長絨棉是國際奢侈品的主要紡織材料，產(chǎn)量低，僅能在新疆、埃及、美國亞利桑那州等少數(shù)干旱地區(qū)種植，因此價格昂貴。

科研人員一直努力想把兩者“魚與熊掌”的優(yōu)勢綜合起來，培育出既高產(chǎn)、適應(yīng)性廣同時纖維更長、更強、更細的棉花品種，而這需要我們對陸地棉和海島棉在產(chǎn)量、品質(zhì)和適應(yīng)性差異形成的遺傳基礎(chǔ)有更深入的了解。

近日，《自然遺傳學(xué)》（Nature Genetics）在線發(fā)表了農(nóng)學(xué)院張?zhí)煺娼淌跔款^的一個國際團隊完成的研究論文。這項研究發(fā)現(xiàn)了陸地棉與海島棉的起源和種間分化的遺傳機制，揭示了陸地棉廣適性、長絨海島棉優(yōu)質(zhì)的遺傳基礎(chǔ)。胡艷副教授、陳杰丹、馬衛(wèi)、博士后張志遠、方磊副教授為論文共同第一作者，張?zhí)煺娼淌跒橥ㄓ嵶髡摺?/span>

海島棉的長絨來自多出十天的“青春期”

基因測序已經(jīng)是當(dāng)前研究領(lǐng)域的重要手段，張?zhí)煺鎴F隊利用了以色列NRGene公司的 DeNovoMAGIC組裝技術(shù)，結(jié)合Bionano光學(xué)圖譜、超高密度遺傳圖譜、Hi-C等輔助技術(shù)，組裝出陸地棉遺傳標(biāo)準(zhǔn)系TM-1和我國自育的海島棉品種Hai7124染色體水平基因組，基因組完整性高有利于實驗的開展。

科研人員在對海陸基因組比較分析后發(fā)現(xiàn)，特異基因表達、擴增和染色體結(jié)構(gòu)變異是海陸馴化后分化的主要原因。其中纖維發(fā)育期間，膜轉(zhuǎn)運、糖合成、碳水化合物代謝通路等相關(guān)基因海、陸差異富集，蔗糖轉(zhuǎn)運、離子轉(zhuǎn)運、液泡轉(zhuǎn)化酶等、液泡中滲透物質(zhì)調(diào)節(jié)等調(diào)控細胞伸長相關(guān)基因在海島棉纖維發(fā)育中的表達持續(xù)時間遠長于陸地棉，是長絨“奢侈棉”產(chǎn)生的主要原因。

開花后0天，10天，15天，20天，25天，30天，35天，40天，TM-1（陸地棉）和Hai7124（海島棉）胚珠上纖維在不同發(fā)育時期的動態(tài)變化

“簡單來說，我們發(fā)現(xiàn)海島棉的長絨，來自更長的青春期。陸地棉一般長15天停下來，但是海島棉生長時間在25天左右，研究中我們從基因?qū)用嬲业搅司唧w原因?！睆?zhí)煺嬲f。

陸地棉的不嬌氣源自不懼冷熱

陸地棉與海島棉另一個區(qū)別在于對成長環(huán)境的要求，已有的研究中，科研人員已經(jīng)發(fā)現(xiàn)陸地棉苗期耐低溫還耐高溫。這次，科研人員在對基因圖譜的分析中發(fā)現(xiàn)，對冷熱不敏感的基因。

陸地棉中有更多的乙烯、ABA信號調(diào)控的基因被激活，調(diào)控對冷、熱等逆境響應(yīng)，這可能與陸地棉的廣適性密切相關(guān)。A01染色體陸地棉大片段序列的漸滲分析發(fā)現(xiàn)，確實存在中亞型或新疆型海島棉。

張?zhí)煺娼榻B，從基因?qū)用嬲业胶u棉與陸地棉的差異，對未來培育具有高產(chǎn)、纖維優(yōu)良、適應(yīng)性強的棉花新品種提供了有力的理論支持。

該項成果得到了國家重點研發(fā)計劃、國家自然科學(xué)基金、浙江大學(xué)優(yōu)勢學(xué)科和溢達集團等大力支持。南京農(nóng)業(yè)大學(xué)、基諾信息科技（深圳）有限公司、以色列NRGene、澳大利亞紐卡斯?fàn)柎髮W(xué)、美國農(nóng)業(yè)部南方研究中心、溢達集團、巴基斯坦國家生物技術(shù)和遺傳改良研究中心、福建農(nóng)林大學(xué)、中科院上海植物生理生態(tài)研究所等國內(nèi)外多家科研機構(gòu)項目參與了本項目的研究。

原文鏈接：https://www.nature.com/articles/s41588-019-0371-5

（柯溢能）