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測測“血型”,育出好瓜不怕裂

發(fā)布時間:2020-04-29來源:浙大新聞辦作者:柯溢能2493

果實開裂是自然界中的常見現(xiàn)象,從進化上來講“瓜熟蒂落”有助于種子的傳播和植物的繁衍。從產(chǎn)業(yè)上來講,田間和采后的果實開裂,都將大大降低經(jīng)濟效益和消費價值。

果實開裂造成巨大產(chǎn)量損失(左:田間裂瓜導(dǎo)致減收或絕收;右:西瓜豐收對比)

從另一個方面講,果皮的耐裂性與果肉品質(zhì)緊密連鎖,導(dǎo)致了“耐裂品種不優(yōu)質(zhì),優(yōu)質(zhì)品種不耐裂”的現(xiàn)象。因而,西瓜果皮堅硬耐裂同時果肉清脆爽口成為了一個重要育種目標(biāo)。這樣一來從田間到餐桌,瓜農(nóng)好種、經(jīng)銷商好賣、消費者覺得好吃,三全其美。

經(jīng)過多年研究,浙江大學(xué)農(nóng)業(yè)與生物技術(shù)學(xué)院張明方教授課題組首次發(fā)現(xiàn)了與新鮮果實耐裂相關(guān)的基因,不僅為進一步闡明果實耐裂性機理提供了新見解,同時也有利于加速耐裂優(yōu)質(zhì)品種的精準(zhǔn)育種,為通過分子標(biāo)記輔助育種等技術(shù)改良西瓜品種的耐裂性提供了重要的靶標(biāo)基因。

這項成果以封面文章發(fā)表在國際知名植物學(xué)雜志《植物生物技術(shù)雜志》Plant Biotechnology Journal)。浙江大學(xué)浙江大學(xué)農(nóng)業(yè)與生物技術(shù)學(xué)院博士生廖南嶠、胡仲遠副教授為共同第一作者,張明方教授為論文的通訊作者。


西瓜皮耐不耐裂,這次找到了評價指標(biāo)

果實裂果是農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中普遍發(fā)生的現(xiàn)象,嚴(yán)重影響果實的產(chǎn)量和商品性。西瓜在生產(chǎn)和物流過程中均易出現(xiàn)裂果現(xiàn)象,每年田間和物流階段的產(chǎn)量損失巨大。

西瓜從唐代經(jīng)古絲綢之路進入中國,也歷經(jīng)自然選擇和人工培育,但卻一直沒有很好的體系評價西瓜皮的耐裂性,傳統(tǒng)的育種家采用感官評價,捏一把或者刀切一下,這種方法完全憑育種者的經(jīng)驗,育種效率低,無法解析果實耐裂機制,也很難打破“耐裂品種不優(yōu)質(zhì)”的桎梏。

如何把耐裂性狀用一個數(shù)值標(biāo)記出來,是張明方課題組這次研究的第一個亮點。他們通過質(zhì)構(gòu)儀選用不同形狀的探頭,測量了果皮硬度、破裂性、破裂率、破裂力做功等8個不同評價指標(biāo)。這些測量數(shù)據(jù)既涵蓋了傳統(tǒng)耐裂性判斷的指標(biāo),更包含了很多傳統(tǒng)方法無法測量的指標(biāo)?!皽?zhǔn)確量化耐裂性狀、精準(zhǔn)定位耐裂基因,能為培育耐裂品種提供重要的理論支撐,具有重要科學(xué)意義和應(yīng)用前景?!?/span>

多個耐裂性狀指標(biāo)的共定位

張明方介紹,果皮硬度就是測量西瓜在破裂瞬間受到的力,破裂性就是機械穩(wěn)定施壓導(dǎo)致果實的主動破裂情況,破裂率就是同樣力切西瓜,會形成主動破裂周長。

根據(jù)這些前期指標(biāo),科研人員用耐裂性顯著差異的西瓜進行雜交,并對400多個西瓜F2代開展實驗性狀調(diào)查??蒲腥藛T在對159個隨機樣本進行單株測序后發(fā)現(xiàn),所有耐裂相關(guān)指標(biāo)都共同定位到西瓜的10號染色體上,而果皮硬度數(shù)據(jù)錨定的區(qū)域最為清晰精確。

在實驗的空隙,最有趣的還是一起吃西瓜。“大家都圍著西瓜做研究,實驗后就圍著吃西瓜,評瓜品味,有些實驗的靈感就是來自于吃西瓜?!?/span>胡仲遠說。


西瓜也有血型,這樣的瓜娃子最好吃

在初步鎖定10號染色體后,課題組創(chuàng)新了單株染色體片段來源分析方法,利用F2個別在候選區(qū)域發(fā)生重組的個體以及他們的自交后代F3群體,通過耐裂表型和基因型關(guān)聯(lián)分析縮小候選區(qū)間,鎖定關(guān)鍵基因,科研人員發(fā)現(xiàn)該區(qū)域存在一個ERF4 基因,是耐裂與否的重要因素。胡仲遠表示:“只用雜交第三代就能精確定位到基因,這是用傳統(tǒng)基因定位方法無法做到的,都是得益于我們創(chuàng)新的表型評價體系和基因挖掘方法?!?/span>

在自然界的不同西瓜種質(zhì)的10號染色體上,存在兩種類型的等位基因ERF4-aERF4-b,與本實驗的耐裂親本擁有相同的ERF4-a基因的西瓜基本都耐裂;而具有ERF4-b基因的則表現(xiàn)為容易開裂;兼而有之的雜合類型,則表現(xiàn)為果皮堅硬,果肉較松脆。張明方用“血型”給這些西瓜樣本打了個比方,耐裂的如果是A型,那么就可以把不耐裂的比成B型,兼而有之的則是AB型。

通過創(chuàng)新研究方法實現(xiàn)耐裂基因的快速精準(zhǔn)定位

由于找到了耐裂性功能基因,課題組很快研發(fā)出分子標(biāo)記物,只要用一點點葉片提取DNA進行分析,就可以很快的測試出西瓜屬于哪個“血型”。在對已有的104個西瓜品種資源進行驗證后,科研人員發(fā)現(xiàn)西瓜的“血型”可以很好地反映耐裂性。另一方面,張明方團隊還對市面上銷售的30余份不同西瓜商品種進行了檢測,發(fā)現(xiàn)只有在設(shè)施栽培的西瓜品種中才會發(fā)現(xiàn)較多的“B型血”,而露地栽培的西瓜品種,基本上全是純合的A型或雜合的AB型。

這是因為“B型血”西瓜的果皮容易開裂,在露地栽培很容易受到雨水等不利因素刺激而發(fā)生田間果實開裂,所以在長期育種過程中,“B型血”被逐步淘汰了。而在設(shè)施栽培條件下,避雨設(shè)施為西瓜提供了保護,不耐裂的西瓜也能較好地生長,育種家們在選育優(yōu)質(zhì)品種的過程中,不知不覺地把不耐裂的“B型血”保留了下來,而耐裂的純合“A型血”由于常常聯(lián)鎖果肉較硬這一不良品質(zhì),就很少被保留在設(shè)施西瓜品種里了。

從我們的日常經(jīng)驗中也可以發(fā)現(xiàn),在露天生長受到風(fēng)吹雨打,西瓜品種的果皮必需更加堅韌?!?/span>胡仲遠說,“事實上在AB型的品種里,更有可能發(fā)現(xiàn)又耐裂又清脆好吃的西瓜?!?/span>

那么是什么讓A型和AB型西瓜更耐裂呢?

課題組繼續(xù)開展研究,他們發(fā)現(xiàn)ERF4 基因是乙烯信號途徑的重要轉(zhuǎn)錄因子,從基因進化角度和結(jié)構(gòu)特征判斷,該基因很可能調(diào)控細(xì)胞壁木質(zhì)素的生長和積累?!澳举|(zhì)素就好像細(xì)胞壁的鋼筋,形成銅墻鐵壁,讓細(xì)胞壁更堅固、更有韌性和硬度?!睆埫鞣秸f。

功能基因的進化分析為功能預(yù)測和后續(xù)機理研究提供重要線索


精準(zhǔn)育種找到新方向

張明方介紹,功能基因的分子標(biāo)記為育種篩選帶來了新的可能。

在之前如果需要篩選品種,需要大量的人力物力栽培巨大的種群進行大量的普查式的性狀研究,而有了分子靶標(biāo),就可以先對各類品種資源進行苗期篩選,再選擇帶有目標(biāo)基因的少量個體進行田間種植。

比如耐裂優(yōu)質(zhì)西瓜的選育,我們不再需要在每個世代開展耐裂性選擇,只需選擇出AAB血型的材料再開展田間種植,再從中選育果肉品質(zhì)佳又較耐裂的個體繁育后代。這樣不僅可以減少每季的種植量,而且不用擔(dān)心耐裂基因在育種過程中“丟失”,獲得目標(biāo)品種的時間也將大大縮短?!皩⒆匀唤缫延械膬?yōu)質(zhì)基因篩選出來,進而開發(fā)相關(guān)分子標(biāo)記,可以大大提高育種的精度和速度?!?/span>

不斷發(fā)掘抗逆、抗病、優(yōu)質(zhì)等相關(guān)功能基因,并利用分子標(biāo)記輔助育種技術(shù),將各種有益性狀高效地集合到我們的育種材料中,選育出田間-物流-餐桌“三全其美”的西瓜新品種,成為了張明方團隊西瓜精準(zhǔn)育種的新方向。

本項目受國家西甜瓜產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系、國家自然科學(xué)基金等項目支持。

(文 柯溢能/圖片由課題組提供)