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基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院馮友軍課題組PLOS Pathogens揭示了一類“FAS II抗菌藥物增敏”的生化機(jī)制

發(fā)布時(shí)間:2024-08-01來(lái)源:基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)系作者:12

細(xì)菌耐藥性已成為全球的嚴(yán)峻挑戰(zhàn),嚴(yán)重威脅人類健康。細(xì)菌通過多種機(jī)制對(duì)抗抗生素,使得一些傳統(tǒng)藥物失去了效力。為了應(yīng)對(duì)這一難題,科學(xué)家們不斷探索新的解決方法。脂肪酸是細(xì)胞膜磷脂的重要組成部分,對(duì)于細(xì)菌的生存至關(guān)重要。細(xì)菌經(jīng)II型脂肪酸合成途徑(FAS II)合成其生存必需的脂肪酸,通過靶向FAS II來(lái)阻斷脂肪酸的合成從而殺死細(xì)菌是一類抗生素作用機(jī)理。然而,細(xì)菌亦并非坐以待斃。部分細(xì)菌可通過acyl-ACP合成酶(AasS)直接攝取外源脂肪酸,從而繞過FAS II途徑。這樣一來(lái),靶向FAS II的抗生素就面臨失效的風(fēng)險(xiǎn)。細(xì)菌的這一狡猾策略,讓科學(xué)家們倍感棘手。但科學(xué)家們沒有輕易認(rèn)輸,繼續(xù)尋找破解細(xì)菌耐藥性的妙招。近期,一種名為C10-AMS的化合物被發(fā)現(xiàn),它可以抑制AasS的活性,從而降低甚至阻斷細(xì)菌攝取外源脂肪酸的能力。這意味著,即使細(xì)菌繞過了FAS II途徑,C10-AMS也能有效地抑制其生存。這一發(fā)現(xiàn)為抗菌研究領(lǐng)域注入了一劑強(qiáng)心針。然而,C10-AMS作為抑制劑的具體作用原理還有待進(jìn)一步研究。

2024715日,浙江大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院馮友軍課題組與公共衛(wèi)生學(xué)院周春課題組、浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院冷凍電鏡中心張興攜手合作,在病原微生物研究領(lǐng)域知名期刊《PLOS Pathogens》發(fā)表題為《An inhibitory mechanism of AasS, an exogenous fatty acid scavenger: Implications for re-sensitization of FAS II antimicrobials》的研究長(zhǎng)文,揭示了AasS抑制劑C10-AMS發(fā)揮功能的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)及生化機(jī)制。通過一系列實(shí)驗(yàn),研究團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)C10-AMS能夠與AasS有效結(jié)合,并阻礙不同長(zhǎng)度的脂肪酰基底物進(jìn)入,進(jìn)而阻斷AasS介導(dǎo)的脂肪酸攝取途徑。利用冷凍電鏡單顆粒技術(shù),研究團(tuán)隊(duì)還解析了AasS/C10-AMS抑制劑的復(fù)合物結(jié)構(gòu),發(fā)現(xiàn)C10-AMS使AasS由“開放構(gòu)象” 轉(zhuǎn)為“封閉構(gòu)象”,大大削弱了AasS的活性。這一發(fā)現(xiàn)如同揭開了細(xì)菌的“防御盾”,讓科學(xué)家們看清了它的弱點(diǎn),為開發(fā)新的抗菌策略提供了寶貴的信息。通過抑制AasS,可以讓靶向FAS II的抗生素重新發(fā)揮作用,幫助克服細(xì)菌耐藥性的問題。未來(lái),C10-AMS及其衍生物有望與FAS II抑制劑聯(lián)合使用,形成“雙劍合璧”的療法,更有效地對(duì)抗部分細(xì)菌的感染。

脂肪酸對(duì)于生命體來(lái)說不可或缺,II型脂肪酸合成途徑(FASII)對(duì)細(xì)菌的存活極為關(guān)鍵,這也是靶向FASII的抗生素發(fā)揮作用的重要機(jī)制。然而研究發(fā)現(xiàn),幾乎所有的細(xì)菌都有一套能夠不利用FASII途徑合成其存活必需的脂肪酸的機(jī)制,而是通過吸收外源脂肪酸來(lái)建立它們的膜磷脂(圖1)。不同細(xì)菌演化出3種脂肪酸攝取機(jī)制,與已知的兩個(gè)系統(tǒng)?;?/span>-CoA合成酶FadDFakA/B激酶通路不同,AasS作為?;?/span>-ACP合成酶代表了第三種eFA利用機(jī)制,它可以繞過FAS II途徑。鑒于AasS獲取eFA的途徑可繞過FAS II的抑制劑(例如Cerulenin),因此利用AasS抑制劑C10-AMS來(lái)逆轉(zhuǎn)FAS II這一通路似乎是可行的(圖1)。

在生化機(jī)制方面,通過體內(nèi)外酶活實(shí)驗(yàn),發(fā)現(xiàn)C10-AMSAasS的結(jié)合能阻礙不同長(zhǎng)度的脂肪?;孜锏倪M(jìn)入,揭示其具有阻斷AasS介導(dǎo)的外源脂肪酸攝取能力(圖2),證明C10-AMS是一種有效的AasS抑制劑,其抑制劑強(qiáng)度Ki值僅約0.6 μM(圖3)。值得一提的是,該研究還利用冷凍電鏡單顆粒技術(shù),揭示了AasS與抑制劑C10-AMS結(jié)合的神秘面紗。除AasS獨(dú)立輪廓外(2.53 Å),該研究獲得了AasS與抑制劑C10-AMS的復(fù)合物結(jié)構(gòu)(2.33 Å)以其與反應(yīng)中間體C10-AMP的復(fù)合物結(jié)構(gòu)(2.19 Å)。結(jié)構(gòu)比對(duì)結(jié)果清晰地表明,AasS存在兩種不同的構(gòu)象:開放構(gòu)象和封閉構(gòu)象。通常情況下,AasS以開放構(gòu)象結(jié)合其天然底物。然而,當(dāng)抑制劑C10-AMSAasS結(jié)合時(shí),它誘導(dǎo)AasS從開放構(gòu)象轉(zhuǎn)變?yōu)榫o密的封閉構(gòu)象。這一結(jié)構(gòu)變化抑制了AasS與其天然底物的結(jié)合,從而有效地抑制了AasS作為Acyl-ACP合成酶的催化活性(圖4)。為了深入理解C10-AMSAasS之間的相互作用,研究團(tuán)隊(duì)開展了一系列突變實(shí)驗(yàn),成功鑒定了AasS結(jié)合C10-AMS的關(guān)鍵殘基。這些關(guān)鍵性的發(fā)現(xiàn),不僅為C10-AMS作為AasS抑制劑的角色提供了有力支撐,也為未來(lái)抗菌藥物的設(shè)計(jì)和開發(fā)提供了詳盡的結(jié)構(gòu)信息。

綜上所述,該研究結(jié)果為抑制AasS利用外源脂肪酸來(lái)逆轉(zhuǎn)FASII通路提供了理論證據(jù),為開發(fā)新的抗菌策略提供了潛在的靶點(diǎn),尤其是由C10-AMS及其衍生物與某些FAS II抑制劑聯(lián)合組成的雙重療法。

馮友軍課題組長(zhǎng)期聚焦“細(xì)菌脂代謝與耐藥/致病性的機(jī)制”研究,發(fā)表重要研究論文60余篇,累計(jì)引用11600余次(h-index: 53)。該研究工作先后獲得了國(guó)家自然科學(xué)基金委的耐藥重點(diǎn)專項(xiàng)(32141001)、重點(diǎn)項(xiàng)目(31830001)以及杰青項(xiàng)目(32125003)的聯(lián)合資助。浙江大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院馮友軍課題組博士生黃昊旻、浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院冷凍電鏡中心常圣海博士和西北工業(yè)大學(xué)崔濤副教授系該研究論文的共同第一作者。浙江大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院馮友軍教授、公共衛(wèi)生學(xué)院周春研究員與浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院冷凍電鏡中心張興教授擔(dān)任該研究論文的共同通訊作者。